1981-1986年任北京大学哲学系教师、讲师，1986年任北京大学哲学系副教授，1990年任北京大学哲学系教授，1993年被国务院学位办评定为博士生导师。1991年被国务院学位委员会、国家教委授予“有突出贡献的中国博士学位获得者”。1992年被国家授予“有突出贡献的中青年专家”并获发“政府特殊津贴”。1998年被评为教育部 “跨世纪人才”。
曾任北京大学儒学研究中心主任、北京大学哲学系学术委员会主任、中国哲学教研室主任。2009年转任清华大学，现任清华大学国学研究院院长，清华大学哲学系教授、博士生导师、校学术委员会副主任。
兼任全国中国哲学史学会会长、国际中国哲学学会(ISCP)副执行长（2002-2008）、全国古籍整理规划小组成员、教育部社会科学委员会委员，教育部学科指导委员会委员、国家社会科学基金学科评审组专家、国家出版基金评审专家、冯友兰研究会会长，朱熹研究会会长，以及首都师范大学特聘讲座教授，香港科技大学、武汉大学、浙江大学、复旦大学等校兼任教授，山东师范大学齐鲁文化研究中心（教育部基地）学术委员会主任、
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